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This page was created to provide a list and details about DatLab protocols for analysis of mitochondrial respiration.
{| class="wikitable"
! style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | Protocol name
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! style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | Step 10
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! style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | Step 19
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| style="font-size:10px;" | D014
| style="font-size:10px;" | PM+G+S_OXPHOS+Rot_ET_pfi
| style="font-size:10px;" | A: Additivity between the N- and  S-pathway in the Q-junction
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-009_AmR_ce-pce_D019
| style="font-size:10px;" | D019
| style="font-size:10px;" | S_OXPHOS_Rot_AmR_pce
| style="font-size:10px;" |
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-009_AmR_mt_D021
| style="font-size:10px;" | D021
| style="font-size:10px;" | S_OXPHOS_Rot_AmR_mt
| style="font-size:10px;" |
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-009_O2_ce-pce_D016
| style="font-size:10px;" | D016
| style="font-size:10px;" | S_OXPHOS_Rot_O2_pce
| style="font-size:10px;" |
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-009_O2_mt_D015
| style="font-size:10px;" | D015
| style="font-size:10px;" | S_OXPHOS_Rot_O2_mt
| style="font-size:10px;" |
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-010_O2_ce-pce_D008
| style="font-size:10px;" | D008
| style="font-size:10px;" | Digitonin test
| style="font-size:10px;" | A: Optimization of digitonin concentration for pce
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-011_O2_pfi_D024
| style="font-size:10px;" | D024
| style="font-size:10px;" | GM+S_OXPHOS+Rot_ET:pfi
| style="font-size:10px;" | A: Maximum mitochondrial respiratory capacity (OXPHOS with NS substrates) and coupling/pathway control
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-012_O2_ce-pce_D052
| style="font-size:10px;" | D052
| style="font-size:10px;" | PM+G_OXPHOS_pce
| style="font-size:10px;" | A: Coupling control (L- P- E) with NADH-linked substrates (PM and PGM)
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-012_O2_mt_D027
| style="font-size:10px;" | D027
| style="font-size:10px;" | PM+G_OXPHOS_mt
| style="font-size:10px;" | A: Coupling control (L- P- E) with NADH-linked substrates (PM and PGM)
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-013_AmR_ce_D023
| style="font-size:10px;" | D023
| style="font-size:10px;" | AmR_ROUTINE
| style="font-size:10px;" |
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-014_O2_pfi_D042
| style="font-size:10px;" | D042
| style="font-size:10px;" | GM+P+S_OXPHOS+Rot_ET_pfi
| style="font-size:10px;" | A: Cells or tissue types that display a preference for GM over PM to support NADH-linked respiration
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-015_O2_pti_D043
| style="font-size:10px;" | D043
| style="font-size:10px;" | F+G+P+S_OXPHOS+Rot_ET
| style="font-size:10px;" | A:  F-pathway in LEAK state and OXPHOS state
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-016_O2_pfi_D044
| style="font-size:10px;" | D044
| style="font-size:10px;" | F+G+S+Rot_OXPHOS+Omy
| style="font-size:10px;" | A: F-pathway in LEAK state and OXPHOS state
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-017_O2_mt _D046
| style="font-size:10px;" | D046
| style="font-size:10px;" | F+G+S_OXPHOS+Rot_ET_mt
| style="font-size:10px;" | A:
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-017_O2_pfi_D049
| style="font-size:10px;" | D049
| style="font-size:10px;" | F+G+S_OXPHOS+Rot_ET_pfi
| style="font-size:10px;" | A:
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-018_AmR_mt_D031
| style="font-size:10px;" | D031
| style="font-size:10px;" | AmR_GMS_mt1
| style="font-size:10px;" |
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-018_AmR_mt_D040
| style="font-size:10px;" | D040
| style="font-size:10px;" | AmR_GMS_mt2
| style="font-size:10px;" |
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-018_AmR_mt_D041
| style="font-size:10px;" | D041
| style="font-size:10px;" | AmR_GMS_mt3
| style="font-size:10px;" |
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-018_O2_mt_D054
| style="font-size:10px;" | D054
| style="font-size:10px;" | O2_GMS_mt4
| style="font-size:10px;" |
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-019_O2_pfi_D045
| style="font-size:10px;" | D045
| style="font-size:10px;" | Pal+Oct+P+G_OXPHOS+S+Rot_ET
| style="font-size:10px;" | A:
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-020_Fluo_mt_D033
| style="font-size:10px;" | D033
| style="font-size:10px;" | PM+G+S+Rot_OXPHOS+Omy_Fluo
| style="font-size:10px;" | A: simultaneous determination of O2 flux and mt-membrane potential
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-020_O2_mt_D032
| style="font-size:10px;" | D032
| style="font-size:10px;" | PM+G+S+Rot_OXPHOS+Omy
| style="font-size:10px;" | A: simultaneous determination of O2 flux and mt-membrane potential
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-021_Fluo_mt_D036
| style="font-size:10px;" | D036
| style="font-size:10px;" | OXPHOS (GM+S+Rot+Omy)_Fluo
| style="font-size:10px;" | A: simultaneous determination of O2 flux and mt-membrane potential
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-021_O2_mt_D035
| style="font-size:10px;" | D035
| style="font-size:10px;" | OXPHOS (GM+S+Rot+Omy)
| style="font-size:10px;" | A: simultaneous determination of O2 flux and mt-membrane potential
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-022 O2 ce D051
| style="font-size:10px;" | D051
| style="font-size:10px;" | AOX (ce CN+SHAM)
| style="font-size:10px;" | A: Determination of the respiration due to the alternative oxidase pathway
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-023 O2 ce D053
| style="font-size:10px;" | D053
| style="font-size:10px;" | AOX-ce SHAM+CN
| style="font-size:10px;" | A: Determination of respiration through the CIII-CIV pathway
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-024_O2_ce-pce_D056
| style="font-size:10px;" | D056
| style="font-size:10px;" | ATPase (PM)
| style="font-size:10px;" | A: Determination of the presence of ATPases in mitochondrial preparations.
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-025_O2_mt_D057
| style="font-size:10px;" | D057
| style="font-size:10px;" | OXPHOS (F+M+P+G+S+Rot)
| style="font-size:10px;" |
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-026_AmR_mt_D064
| style="font-size:10px;" | D064
| style="font-size:10px;" | S+Rot_OXPHOS_AmR
| style="font-size:10px;" |
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-026_O2_mt_D063
| style="font-size:10px;" | D063
| style="font-size:10px;" | S+Rot_OXPHOS
| style="font-size:10px;" |
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-027_O2_ce-pce_D065
| style="font-size:10px;" | D065
| style="font-size:10px;" | Malate anaplerosis
| style="font-size:10px;" | A: Malate anaplerotic pathway
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-006_Fluo_mt_D034_chemical background
| style="font-size:10px;" | D034_chemical backgr.
| style="font-size:10px;" | CCP-mtprep_chemical background
| style="font-size:10px;" | A: Coupling control protocol, mtprep
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-020_Fluo_mt_D033_chemical_background
| style="font-size:10px;" | D033_chemical backgr.
| style="font-size:10px;" | PM+G+S+Rot_OXPHOS+Omy_chemical background
| style="font-size:10px;" | A: simultaneous determination of O2 flux and mt-membrane potential
|-
| style="font-size:10px; background-color:#c0c0c0; color:#333333;" | SUIT-021_Fluo_mt_D036_chemical background
| style="font-size:10px;" | D036_chemical backgr.
| style="font-size:10px;" | OXPHOS (GM+S+Rot+Omy)_chemical background
| style="font-size:10px;" | A: simultaneous determination of O2 flux and mt-membrane potential
|}

Latest revision as of 17:21, 21 May 2024

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